Описание доменной структуры белка IDH_ECOLI

В белке имеется единственный домена Iso_dh (обозначен зелёным цветом) и область низкой сложности. Идентификатор Pfam — PF00180 Сокращенное название — Iso_dh Полное название на русском языке — Изоцитратдегидрогеназа. Положение домена в последовательности — 28-412 а.о Положение участка низкой сложности — 318-329 а.о

Изоцитратдегидрогеназа (IDH) - важный фермент метоболизиа углеводов, который катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата в кетоглуторат. IDH завизит от NAD⁺ и NADp⁺. В эукариотах имеется по крайней мере три изозима ( ферменты с одинаковой активностью, но разной субединичной структурой ): два расположены в митохондриальном матриксе, а третий является цитоплазмотическим. В Escherichia coli деятельность изоцитратдегидрогеназа, зависящая от NADp⁺, управляется фосфорилированием остатка серина: фосфорилированная форма изоцитратдегидрогеназы полностью инактивирована.

3-изопропилмалатизомераза катализирует третий шаг в биосинтезе лейцина в бактериях и грибах: окислительное декарбоксилирование 3-изопропилмалата в 2-оксо-4-метилвалерат.

Тартратдегидрогеназа катализирует превращение тартрата в оксалоглутолат

На рисунке изображена трёхмерная структура белка IDH_ECOLI, взятая со страницы базы данных Pfam. Домен Iso_dh выделен зелёным цветом, он располагается на всем протяжение аминокислотной последовательности, за исключением небольшого N-концевого участка (выделен серым цветом.) В шариковой модели представлены лиганды: Ica и Nap. Идентификатор PDB — 1ai2.

Описание семейства доменов, к которому относится домен Iso_dh